Europska komisija je u prosincu 2015. godine usvojila Radni program za program Europa za građane za 2016. godinu kojim su, između ostaloga, definirani prioriteti Programa.
Od 2016. godine više neće postojati jednogodišnji prioriteti već višegodišnji prioriteti za čitavo razdoblje od 2016. do 2010. godine. Cilj ove promjene jest potencijalnim korisnicima dati više vremena za planiranje i pripremu projektnih prijedloga. Nadležnost za program Europa za građane službeno je preuzela Glavna uprava za migracije i unutarnje poslove (DG HOME).
Uz prioritete Programa, poseban naglasak će se stavljati i na teme imigrantske krize te je savjet da projektni prijedlozi barem dijelom pokrivaju tu temu.